近日，華南農(nóng)業(yè)大學國家生豬種業(yè)工程技術(shù)研究中心主任、溫氏食品集團首席科學家吳珍芳教授團隊在國際權(quán)威學術(shù)期刊《Nature Communications》（中科院一區(qū)TOP期刊，影響因子15.7）上在線發(fā)表了題為“Rewiring of 3D chromatin topology orchestrates transcriptional reprogramming in muscle fiber-type specification and transformation”的重要研究成果。
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浙江大學畢業(yè)、華南農(nóng)業(yè)大學博后以第一作者在Nature Communications發(fā)表重要研究成果，從爭議到共識
該研究聚焦豬肌纖維類型的組成及其對肉質(zhì)風味、嫩度和保水能力的影響，首次系統(tǒng)揭示了肌纖維類型分化與轉(zhuǎn)化的分子機制，為改善豬肉品質(zhì)提供了新的理論支持。研究人員通過構(gòu)建氧化型比目魚肌和酵解型趾長伸肌的順式調(diào)控圖譜及高分辨率染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)圖譜，識別出與肌肉收縮和氧化代謝相關(guān)的關(guān)鍵增強子-啟動子-轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡。研究重點發(fā)現(xiàn)：超級增強子可通過直接結(jié)合啟動子近端區(qū)域或促進遠端染色質(zhì)環(huán)互作，調(diào)控肌纖維分化的方向；同時通過激活STARD7基因表達，降低細胞內(nèi)活性氧水平和MAPK信號通路活性，從而促使酵解型肌纖維向氧化型轉(zhuǎn)變。
這是首次在豬骨骼肌中解析不同代謝類型下染色質(zhì)三維構(gòu)象及其介導的基因調(diào)控差異。研究綜合運用表觀基因組學與三維基因組學方法，并結(jié)合分子實驗手段，闡明了超級增強子在肌纖維類型決定中的作用機制。這一成果不僅為提升豬肉品質(zhì)提供了新的育種靶點，也為利用功能位點突變技術(shù)定向調(diào)控肌纖維比例奠定了理論基礎。
本研究拓展了我們對肌肉品質(zhì)遺傳調(diào)控的認知。增強子等順式調(diào)控元件的表觀修飾狀態(tài)及其引發(fā)的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)變化，可能是肌纖維分化與類型轉(zhuǎn)換的關(guān)鍵分子開關(guān)。研究以瘦肉型杜洛克豬的氧化型比目魚?。⊿OL）和酵解型趾長伸?。‥DL）為模型，結(jié)合ChIP-seq與Hi-C等多種組學技術(shù)，系統(tǒng)解析了超級增強子介導的染色質(zhì)三維互作在肌纖維類型定向分化中的功能與機制。
研究進一步揭示了不同類型骨骼肌中增強子-啟動子三維互作模式的差異。結(jié)果顯示，超級增強子協(xié)同特定轉(zhuǎn)錄因子，通過形成染色質(zhì)環(huán)或近端互作，激活如MYH4等關(guān)鍵肌纖維類型決定基因的表達，進而影響肌纖維的分化方向。此外，STARD7基因通過抑制活性氧生成和ERK信號通路，促進肌纖維向氧化型轉(zhuǎn)化，其自身表達也受到超級增強子介導的染色質(zhì)環(huán)調(diào)控。這項研究不僅有助于推動畜禽肉類品質(zhì)改良技術(shù)的發(fā)展，也為人類肌肉代謝性疾病的治療提供了潛在參考。
本論文由華南農(nóng)業(yè)大學動物科學學院吳珍芳教授、顧婷副教授、李紫聰教授共同擔任通訊作者，博士畢業(yè)生譚寶華、洪林君副教授、博士研究生肖麗窈為共同第一作者。美國德克薩斯大學圣安東尼奧醫(yī)學健康中心（UTHSA）欒宇助理教授在數(shù)據(jù)分析方面給予了專業(yè)指導。楊杰教授、羅文副教授、張澤賓副教授、楊化強副研究員以及徐錚高級實驗師等也為項目順利完成提供了重要支持。
